<div dir="ltr"><div><br clear="all">I download the <a href="http://www.mpich.org/static/tarballs/1.2.1p1/mpich2-1.2.1p1.tar.gz"><font color="#0066cc">mpich2-1.2.1p1.tar.gz</font></a> package, unzip and mkdir /home/bob/mpich2-1.2.1p1</div>
<div> </div><div>then I mkdir /home/bob/mpich2-1.2.1p1-install</div><div> </div><div>then I run ./configure --prefix=/home/bob/mpich2-1.2.1-install --exec-prefix=/usr/local/lib/pkgconfig --enable-fast=all, 03<br></div><div>
 </div><div><font size="1">THE OUTPUT IS FOLLOWING:<font size="1"><p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>Configuring MPICH2 version 1.2.1p1 with  '--prefix=/home/bob/mpich2-1.2.1-install' '--exec-prefix=/usr/local/lib/pkgconfig' '--enable-fast=all,' '03' 'build_alias=03' 'host_alias=03' 'target_alias=03'</p>

<p>Running on system: CYGWIN_NT-6.1 PC 1.7.17(0.262/5/3) 2012-10-19 14:39 i686 Cygwin</p>
<p>Executing mpich2prereq in /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3 with</p>
<p>Executing mpich2prereq in /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd/mpich2prereq</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/hydra/mpich2prereq</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/gforker/mpich2prereq</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd/setup_pm</p>
<p>checking for 03-gcc... no</p>
<p>checking for gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking whether the compiler defines __func__... yes</p>
<p>checking whether the compiler defines __FUNC__... no</p>
<p>checking whether the compiler sets __FUNCTION__... yes</p>
<p>checking whether C compiler accepts option -O2... yes</p>
<p>checking whether routines compiled with -O2 can be linked with ones compiled without -O2... yes</p>
<p>checking for type of weak symbol alias support... pragma weak does not work outside of a file</p>
<p>no</p>
<p>checking whether __attribute__ ((weak)) allowed... yes</p>
<p>checking whether __attribute ((weak_import)) allowed... yes</p>
<p>checking for 03-g77... no</p>
<p>checking for 03-xlf... no</p>
<p>checking for 03-f77... no</p>
<p>checking for 03-frt... no</p>
<p>checking for 03-pgf77... no</p>
<p>checking for 03-cf77... no</p>
<p>checking for 03-fort77... no</p>
<p>checking for 03-fl32... no</p>
<p>checking for 03-af77... no</p>
<p>checking for 03-xlf90... no</p>
<p>checking for 03-f90... no</p>
<p>checking for 03-pgf90... no</p>
<p>checking for 03-pghpf... no</p>
<p>checking for 03-epcf90... no</p>
<p>checking for 03-gfortran... no</p>
<p>checking for 03-g95... no</p>
<p>checking for 03-xlf95... no</p>
<p>checking for 03-f95... no</p>
<p>checking for 03-fort... no</p>
<p>checking for 03-ifort... no</p>
<p>checking for 03-ifc... no</p>
<p>checking for 03-efc... no</p>
<p>checking for 03-pgf95... no</p>
<p>checking for 03-lf95... no</p>
<p>checking for 03-ftn... no</p>
<p>checking for g77... g77</p>
<p>checking whether we are using the GNU Fortran 77 compiler... yes</p>
<p>checking whether g77 accepts -g... yes</p>
<p>checking whether Fortran 77 compiler accepts option -O2... yes</p>
<p>checking whether routines compiled with -O2 can be linked with ones compiled without -O2... yes</p>
<p>checking how to get verbose linking output from g77... -v</p>
<p>checking for Fortran 77 libraries of g77...  -L/usr/lib/gcc/i686-pc-cygwin/3.4.4 -L/usr/lib/gcc/i686-pc-cygwin/3.4.4/../../.. -lfrtbegin -lg2c -lcygwin -luser32 -lkernel32 -ladvapi32 -lshell32</p>
<p>checking whether g77 accepts the FLIBS found by autoconf... yes</p>
<p>checking whether C can link with  -L/usr/lib/gcc/i686-pc-cygwin/3.4.4 -L/usr/lib/gcc/i686-pc-cygwin/3.4.4/../../.. -lfrtbegin -lg2c -lcygwin -luser32 -lkernel32 -ladvapi32 -lshell32... yes</p>
<p>checking for linker for Fortran main programs... Use Fortran to link programs</p>
<p>checking whether Fortran 77 and C objects are compatible... yes</p>
<p>checking for Fortran 77 name mangling... lower doubleunderscore</p>
<p>checking what libraries are needed to link Fortran programs with C routines that use stdio... none</p>
<p>checking whether Fortran init will work with C... yes</p>
<p>checking for 03-f90... no</p>
<p>checking for 03-xlf90... no</p>
<p>checking for 03-pgf90... no</p>
<p>checking for 03-ifort... no</p>
<p>checking for 03-epcf90... no</p>
<p>checking for 03-f95... no</p>
<p>checking for 03-fort... no</p>
<p>checking for 03-xlf95... no</p>
<p>checking for 03-lf95... no</p>
<p>checking for 03-pathf95... no</p>
<p>checking for 03-pathf90... no</p>
<p>checking for 03-g95... no</p>
<p>checking for 03-gfortran... no</p>
<p>checking for 03-ifc... no</p>
<p>checking for 03-efc... no</p>
<p>checking for f90... no</p>
<p>checking for xlf90... no</p>
<p>checking for pgf90... no</p>
<p>checking for ifort... no</p>
<p>checking for epcf90... no</p>
<p>checking for f95... no</p>
<p>checking for fort... no</p>
<p>checking for xlf95... no</p>
<p>checking for lf95... no</p>
<p>checking for pathf95... no</p>
<p>checking for pathf90... no</p>
<p>checking for g95... no</p>
<p>checking for gfortran... gfortran</p>
<p>checking that f works as the extension for Fortran 90 program... yes</p>
<p>checking whether we are using the GNU Fortran 90 compiler... yes</p>
<p>checking whether gfortran accepts -g... yes</p>
<p>checking for extension for Fortran 90 programs... f90</p>
<p>checking whether the Fortran 90 compiler (gfortran  -DNDEBUG ) works... yes</p>
<p>checking whether the Fortran 90 compiler (gfortran  -DNDEBUG ) is a cross-compiler... no</p>
<p>checking whether Fortran 90 works with Fortran 77... cat: conftest.f90: No such file or directory</p>
<p>Output from the link step is</p>
<p>/tmp/ccYCQbvY.o:conftest1.f90:(.text+0x14): undefined reference to `_t1_2_'</p>
<p>collect2: ld returned 1 exit status</p>
<p>no</p>
<p>configure: WARNING: The test program that was used and the output may be found in config.log</p>
<p>configure: WARNING: The selected Fortran 90 compiler gfortran does not work with the selected Fortran 77 compiler g77.  Use the environment variables F90 and F77 respectively to select compatible Fortran compilers.  The check here tests to see if a main program compiled with the Fortran 90 compiler can link with a subroutine compiled with the Fortran 77 compiler.</p>

<p>checking whether Fortran accepts ! for comments... yes</p>
<p>checking for include directory flag for Fortran... -I</p>
<p>checking for Fortran 77 flag for library directories... -L</p>
<p>checking for which Fortran libraries are needed to link C with Fortran... none</p>
<p>checking whether Fortran compiler processes .F files with C preprocessor... yes</p>
<p>checking for c++... c++</p>
<p>checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes</p>
<p>checking whether c++ accepts -g... yes</p>
<p>checking whether the C++ compiler c++ can build an executable... yes</p>
<p>checking whether C++ compiler works with string... yes</p>
<p>checking whether the compiler supports exceptions... yes</p>
<p>checking whether the compiler recognizes bool as a built-in type... yes</p>
<p>checking whether the compiler implements namespaces... yes</p>
<p>checking whether <iostream> available... yes</p>
<p>checking whether the compiler implements the namespace std... yes</p>
<p>checking whether <math> available... no</p>
<p>checking for GNU g++ version... 4 . 5</p>
<p>checking whether C++ compiler accepts option -O2... yes</p>
<p>checking whether routines compiled with -O2 can be linked with ones compiled without -O2... yes</p>
<p>checking for perl... /usr/bin/perl</p>
<p>checking for ar... ar</p>
<p>checking for ranlib... ranlib</p>
<p>checking for killall... killall</p>
<p>checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c</p>
<p>checking whether install works... yes</p>
<p>checking for 03-ranlib... (cached) ranlib</p>
<p>checking whether install breaks libraries... no</p>
<p>checking whether mkdir -p works... yes</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... no</p>
<p>checking for bash... /usr/bin/bash</p>
<p>checking whether /usr/bin/bash supports arrays... yes</p>
<p>checking for doctext... false</p>
<p>checking for location of doctext style files... unavailable</p>
<p>checking for an ANSI C-conforming const... yes</p>
<p>checking for working volatile... yes</p>
<p>checking for C/C++ restrict keyword... __restrict</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking whether __attribute__ allowed... yes</p>
<p>checking whether __attribute__((format)) allowed... yes</p>
<p>checking whether byte ordering is bigendian... no</p>
<p>checking whether C compiler allows unaligned doubles... yes</p>
<p>checking whether gcc supports __func__... yes</p>
<p>Using gcc to determine dependencies</p>
<p>checking whether long double is supported... yes</p>
<p>checking whether long long is supported... yes</p>
<p>checking for max C struct integer alignment... eight</p>
<p>checking for max C struct floating point alignment... four</p>
<p>checking for max C struct alignment of structs with doubles... eight</p>
<p>checking for max C struct floating point alignment with long doubles... four</p>
<p>configure: WARNING: Structures containing long doubles may be aligned differently from structures with floats or longs.  MPICH2 does not handle this case automatically and you should avoid assumed extents for structures containing float types.</p>

<p>checking if alignment of structs with doubles is based on position... no</p>
<p>checking if alignment of structs with long long ints is based on position... no</p>
<p>checking if double alignment breaks rules, find actual alignment... no</p>
<p>checking for alignment restrictions on pointers... int or better</p>
<p>checking size of char... 1</p>
<p>checking size of unsigned char... 1</p>
<p>checking size of short... 2</p>
<p>checking size of unsigned short... 2</p>
<p>checking size of int... 4</p>
<p>checking size of unsigned int... 4</p>
<p>checking size of long... 4</p>
<p>checking size of unsigned long... 4</p>
<p>checking size of long long... 8</p>
<p>checking size of unsigned long long... 8</p>
<p>checking size of float... 4</p>
<p>checking size of double... 8</p>
<p>checking size of long double... 12</p>
<p>checking size of void *... 4</p>
<p>checking for ANSI C header files... no</p>
<p>checking stddef.h usability... yes</p>
<p>checking stddef.h presence... yes</p>
<p>checking for stddef.h... yes</p>
<p>checking size of wchar_t... 2</p>
<p>checking size of float_int... 8</p>
<p>checking size of double_int... 16</p>
<p>checking size of long_int... 8</p>
<p>checking size of short_int... 8</p>
<p>checking size of two_int... 8</p>
<p>checking size of long_double_int... 16</p>
<p>checking sys/bitypes.h usability... no</p>
<p>checking sys/bitypes.h presence... no</p>
<p>checking for sys/bitypes.h... no</p>
<p>checking inttypes.h usability... yes</p>
<p>checking inttypes.h presence... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking stdint.h usability... yes</p>
<p>checking stdint.h presence... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for int8_t... yes</p>
<p>checking for int16_t... yes</p>
<p>checking for int32_t... yes</p>
<p>checking for int64_t... yes</p>
<p>checking for uint8_t... yes</p>
<p>checking for uint16_t... yes</p>
<p>checking for uint32_t... yes</p>
<p>checking for uint64_t... yes</p>
<p>checking size of _Bool... 1</p>
<p>checking size of float _Complex... 8</p>
<p>checking size of double _Complex... 16</p>
<p>checking size of long double _Complex... 24</p>
<p>checking for _Bool... yes</p>
<p>checking for float _Complex... yes</p>
<p>checking for double _Complex... yes</p>
<p>checking for long double _Complex... yes</p>
<p>checking for size of Fortran type integer... 4</p>
<p>checking for size of Fortran type real... 4</p>
<p>checking for size of Fortran type double precision... 8</p>
<p>checking whether integer*1 is supported... yes</p>
<p>checking whether integer*2 is supported... yes</p>
<p>checking whether integer*4 is supported... yes</p>
<p>checking whether integer*8 is supported... yes</p>
<p>checking whether integer*16 is supported... no</p>
<p>checking whether real*4 is supported... yes</p>
<p>checking whether real*8 is supported... yes</p>
<p>checking whether real*16 is supported... no</p>
<p>checking for C type matching Fortran integer... int</p>
<p>checking for size of MPI_Status... 20</p>
<p>checking for values of Fortran logicals... True is 1 and False is 0</p>
<p>checking for Fortran 90 integer kind for 4-byte integers... 4</p>
<p>checking for Fortran 90 integer kind for 8-byte integers... 8</p>
<p>checking whether real*8 is supported in Fortran 90... yes</p>
<p>checking size of bool... 1</p>
<p>checking how to run the C++ preprocessor... c++ -E</p>
<p>checking complex usability... yes</p>
<p>checking complex presence... yes</p>
<p>checking for complex... yes</p>
<p>checking size of Complex... 8</p>
<p>checking size of DoubleComplex... 16</p>
<p>checking size of LongDoubleComplex... 24</p>
<p>checking if char * pointers use byte addresses... yes</p>
<p>checking for alignment restrictions on ... no</p>
<p>checking for alignment restrictions on int32_t... no</p>
<p>checking size of MPIR_Bsend_data_t... 56</p>
<p>checking for gcc __asm__ and pentium cmpxchgl instruction... yes</p>
<p>checking for gcc __asm__ and AMD x86_64 cmpxchgq instruction... no</p>
<p>checking for gcc __asm__ and IA64 xchg4 instruction... no</p>
<p>checking for ANSI C header files... (cached) no</p>
<p>checking stdlib.h usability... yes</p>
<p>checking stdlib.h presence... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking stdarg.h usability... yes</p>
<p>checking stdarg.h presence... yes</p>
<p>checking for stdarg.h... yes</p>
<p>checking sys/types.h usability... yes</p>
<p>checking sys/types.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking string.h usability... yes</p>
<p>checking string.h presence... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... (cached) yes</p>
<p>checking limits.h usability... yes</p>
<p>checking limits.h presence... yes</p>
<p>checking for limits.h... yes</p>
<p>checking for stddef.h... (cached) yes</p>
<p>checking errno.h usability... yes</p>
<p>checking errno.h presence... yes</p>
<p>checking for errno.h... yes</p>
<p>checking sys/socket.h usability... yes</p>
<p>checking sys/socket.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/socket.h... yes</p>
<p>checking sys/time.h usability... yes</p>
<p>checking sys/time.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/time.h... yes</p>
<p>checking unistd.h usability... yes</p>
<p>checking unistd.h presence... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking endian.h usability... yes</p>
<p>checking endian.h presence... yes</p>
<p>checking for endian.h... yes</p>
<p>checking assert.h usability... yes</p>
<p>checking assert.h presence... yes</p>
<p>checking for assert.h... yes</p>
<p>checking sys/param.h usability... yes</p>
<p>checking sys/param.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/param.h... yes</p>
<p>checking for sys/uio.h... yes</p>
<p>checking for size_t... yes</p>
<p>checking for setitimer... yes</p>
<p>checking for alarm... yes</p>
<p>checking for vsnprintf... yes</p>
<p>checking for vsprintf... yes</p>
<p>checking whether vsnprintf needs a declaration... no</p>
<p>checking for strerror... yes</p>
<p>checking for strncasecmp... yes</p>
<p>checking for snprintf... yes</p>
<p>checking whether snprintf needs a declaration... no</p>
<p>checking for va_copy... yes</p>
<p>checking for variable argument list macro functionality... yes</p>
<p>checking valgrind.h usability... no</p>
<p>checking valgrind.h presence... no</p>
<p>checking for valgrind.h... no</p>
<p>checking memcheck.h usability... no</p>
<p>checking memcheck.h presence... no</p>
<p>checking for memcheck.h... no</p>
<p>checking valgrind/valgrind.h usability... no</p>
<p>checking valgrind/valgrind.h presence... no</p>
<p>checking for valgrind/valgrind.h... no</p>
<p>checking valgrind/memcheck.h usability... no</p>
<p>checking valgrind/memcheck.h presence... no</p>
<p>checking for valgrind/memcheck.h... no</p>
<p>checking for working alloca.h... yes</p>
<p>checking for alloca... yes</p>
<p>checking for strdup... yes</p>
<p>checking whether strdup needs a declaration... no</p>
<p>checking for mkstemp... yes</p>
<p>checking whether mkstemp needs a declaration... no</p>
<p>checking for fdopen... yes</p>
<p>checking whether fdopen needs a declaration... yes</p>
<p>checking for putenv... yes</p>
<p>checking whether putenv needs a declaration... no</p>
<p>checking for clock_gettime... yes</p>
<p>checking for clock_getres... yes</p>
<p>checking for gethrtime... no</p>
<p>checking for gettimeofday... yes</p>
<p>checking for clock_gettime in -lrt... yes</p>
<p>checking for clock_getres... (cached) yes</p>
<p>checking whether struct timespec is defined in time.h... yes</p>
<p>checking for CLOCK_REALTIME defined in time.h... yes</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/setup_device</p>
<p>RUNNING SETUP_DEVICE FOR THE CH3 DEVICE</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/setup_channel</p>
<p>RUNNING SETUP_CHANNEL FOR THE NEMESIS CHANNEL</p>
<p>sourcing /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks/setup</p>
<p>RUNNING SETUP FOR THE PROCESS LOCKS MODULE</p>
<p>SPARC V9 inline spin locks supported...no</p>
<p>SPARC V8 inline spin locks supported...no</p>
<p>checking pthread.h usability... yes</p>
<p>checking pthread.h presence... yes</p>
<p>checking for pthread.h... yes</p>
<p>checking for fgrep... /usr/bin/fgrep</p>
<p>checking for pthread_key_create in -lpthread... yes</p>
<p>checking for pthread_yield... yes</p>
<p>checking for pthread_key_create... yes</p>
<p>checking for pthread_cleanup_push... no</p>
<p>checking whether pthread_cleanup_push is available (may be a macro in pthread.h)... no</p>
<p>checking whether pthread.h defines PTHREAD_MUTEX_RECURSIVE_NP... no</p>
<p>checking whether pthread.h defines PTHREAD_MUTEX_RECURSIVE... yes</p>
<p>checking whether pthread.h defines PTHREAD_MUTEX_ERRORCHECK_NP... no</p>
<p>checking whether pthread.h defines PTHREAD_MUTEX_ERRORCHECK... yes</p>
<p>checking for sched_yield... yes</p>
<p>checking for yield... no</p>
<p>checking for usleep... yes</p>
<p>checking for sleep... yes</p>
<p>checking for select... yes</p>
<p>checking for getpid... yes</p>
<p>checking for sched_setaffinity... no</p>
<p>checking for sched_getaffinity... no</p>
<p>checking for bindprocessor... no</p>
<p>checking for thread_policy_set... no</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/openpa</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors</p>
<p>checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c</p>
<p>checking whether build environment is sane... yes</p>
<p>checking for a thread-safe mkdir -p... mkdir -p</p>
<p>checking for gawk... gawk</p>
<p>checking whether make sets $(MAKE)... yes</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for style of include used by make... GNU</p>
<p>checking dependency style of gcc... gcc3</p>
<p>checking for 03-ranlib... ranlib</p>
<p>checking whether to enable assertions... yes</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking pthread.h usability... yes</p>
<p>checking pthread.h presence... yes</p>
<p>checking for pthread.h... yes</p>
<p>checking atomic.h usability... no</p>
<p>checking atomic.h presence... no</p>
<p>checking for atomic.h... no</p>
<p>checking intrin.h usability... no</p>
<p>checking intrin.h presence... no</p>
<p>checking for intrin.h... no</p>
<p>checking for inttypes.h... (cached) yes</p>
<p>checking for stdint.h... (cached) yes</p>
<p>checking for C/C++ restrict keyword... __restrict</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking for an ANSI C-conforming const... yes</p>
<p>checking for pthread_create in -lpthread... yes</p>
<p>checking for pthread_yield... yes</p>
<p>checking if 100 threads can be run at once... yes</p>
<p>checking size of void *... 4</p>
<p>checking size of int... 4</p>
<p>checking whether __attribute__ allowed... yes</p>
<p>checking whether __attribute__((format)) allowed... yes</p>
<p>checking if compiler rejects bogus asm statements... yes</p>
<p>checking for support for gcc x86/x86_64 bit primitives... yes</p>
<p>checking for support for gcc x86 bit primitives for pre-Pentium 4... yes</p>
<p>checking for support for gcc ia64 primitives... no</p>
<p>checking for support for gcc PowerPC atomics... no</p>
<p>checking for support for gcc SiCortex atomics... no</p>
<p>checking for support for gcc atomic intrinsics... yes</p>
<p>checking for support for Windows NT atomic intrinsics... no</p>
<p>checking for support for Sun atomic operations library... no</p>
<p>checking whether to enable strict fairness checks... no</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating src/Makefile</p>
<p>config.status: creating test/Makefile</p>
<p>config.status: creating openpa.pc</p>
<p>config.status: creating src/config.h</p>
<p>config.status: src/config.h is unchanged</p>
<p>config.status: executing src/opa_config.h commands</p>
<p>config.status: creating src/opa_config.h - prefix OPA for src/config.h defines</p>
<p>config.status: src/opa_config.h is unchanged</p>
<p>config.status: executing depfiles commands</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/mpid/ch3</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>RUNNING CONFIGURE FOR CH3 DEVICE</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... yes</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>16</p>
<p>checking assert.h usability... yes</p>
<p>checking assert.h presence... yes</p>
<p>checking for assert.h... yes</p>
<p>checking limits.h usability... yes</p>
<p>checking limits.h presence... yes</p>
<p>checking for limits.h... yes</p>
<p>checking for string.h... (cached) yes</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking sys/uio.h usability... yes</p>
<p>checking sys/uio.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/uio.h... yes</p>
<p>checking uuid/uuid.h usability... yes</p>
<p>checking uuid/uuid.h presence... yes</p>
<p>checking for uuid/uuid.h... yes</p>
<p>checking time.h usability... yes</p>
<p>checking time.h presence... yes</p>
<p>checking for time.h... yes</p>
<p>checking ctype.h usability... yes</p>
<p>checking ctype.h presence... yes</p>
<p>checking for ctype.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking arpa/inet.h usability... yes</p>
<p>checking arpa/inet.h presence... yes</p>
<p>checking for arpa/inet.h... yes</p>
<p>checking sys/socket.h usability... yes</p>
<p>checking sys/socket.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/socket.h... yes</p>
<p>checking for net/if.h... yes</p>
<p>checking for pid_t... yes</p>
<p>checking for inet_pton... yes</p>
<p>checking for gethostname... yes</p>
<p>checking whether gethostname needs a declaration... no</p>
<p>checking for CFUUIDCreate... no</p>
<p>checking for uuid_generate... no</p>
<p>checking for time... yes</p>
<p>checking whether CPP accepts variable length argument lists... yes</p>
<p>checking whether byte ordering is bigendian... no</p>
<p>checking whether we can use struct ifconf... yes</p>
<p>checking size of int... 4</p>
<p>checking size of long... 4</p>
<p>checking size of long long... 8</p>
<p>checking size of void *... 4</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating src/Makefile</p>
<p>config.status: creating util/Makefile</p>
<p>config.status: creating util/shm/Makefile</p>
<p>config.status: creating util/shmbase/Makefile</p>
<p>config.status: creating channels/Makefile</p>
<p>config.status: creating util/ftb/Makefile</p>
<p>config.status: creating localdefs</p>
<p>config.status: creating include/mpid_thread.h</p>
<p>config.status: creating include/mpidi_ch3_conf.h</p>
<p>config.status: include/mpidi_ch3_conf.h is unchanged</p>
<p>config.status: executing default-1 commands</p>
<p>copying ./../common/thread/mpid_thread_mpe.c to src/mpid_thread.c</p>
<p>=== configuring in channels/nemesis (/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis)</p>
<p>configure: running /bin/sh ./configure --disable-option-checking '--prefix=/home/bob/mpich2-1.2.1-install'  '--exec-prefix=/usr/local/lib/pkgconfig' '--enable-fast=all,' '03' 'build_alias=03' 'host_alias=03' 'target_alias=03' '--disable-checkerrors' '--with-atomic-primitives=auto_allow_emulation' 'CC=gcc' 'CFLAGS= -DNDEBUG -O2' 'LDFLAGS= -lrt' 'LIBS= -lpthread' 'CPPFLAGS= -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src -DUSE_PROCESS_LOCKS' --cache-file=/dev/null --srcdir=.</p>

<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>RUNNING CONFIGURE FOR THE NEMESIS CHANNEL</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... yes</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking for pid_t... yes</p>
<p>checking for net/if.h... yes</p>
<p>checking assert.h usability... yes</p>
<p>checking assert.h presence... yes</p>
<p>checking for assert.h... yes</p>
<p>checking netdb.h usability... yes</p>
<p>checking netdb.h presence... yes</p>
<p>checking for netdb.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking sched.h usability... yes</p>
<p>checking sched.h presence... yes</p>
<p>checking for sched.h... yes</p>
<p>checking sys/mman.h usability... yes</p>
<p>checking sys/mman.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/mman.h... yes</p>
<p>checking sys/ioctl.h usability... yes</p>
<p>checking sys/ioctl.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/ioctl.h... yes</p>
<p>checking sys/socket.h usability... yes</p>
<p>checking sys/socket.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/socket.h... yes</p>
<p>checking sys/sockio.h usability... no</p>
<p>checking sys/sockio.h presence... no</p>
<p>checking for sys/sockio.h... no</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking errno.h usability... yes</p>
<p>checking errno.h presence... yes</p>
<p>checking for errno.h... yes</p>
<p>checking sys/ipc.h usability... yes</p>
<p>checking sys/ipc.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/ipc.h... yes</p>
<p>checking sys/shm.h usability... yes</p>
<p>checking sys/shm.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/shm.h... yes</p>
<p>checking for netinet/in.h... yes</p>
<p>checking for mkstemp... yes</p>
<p>checking for rand... yes</p>
<p>checking for srand... yes</p>
<p>checking for OpenPA atomic primitive availability... yes</p>
<p>checking for mmap... yes</p>
<p>checking for munmap... yes</p>
<p>configure: Using a memory-mapped file for shared memory</p>
<p>checking whether struct hostent contains h_addr_list... yes</p>
<p>checking whether we can use struct ifconf... yes</p>
<p>checking knem_io.h usability... no</p>
<p>checking knem_io.h presence... no</p>
<p>checking for knem_io.h... no</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating src/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/src/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/utils/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/utils/replacements/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/utils/monitor/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/elan/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/gm/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/mx/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/tcp/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/ib/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/psm/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/newmad/Makefile</p>
<p>config.status: creating nemesis/netmod/none/Makefile</p>
<p>config.status: creating localdefs</p>
<p>config.status: creating nemesis/include/mpid_nem_net_module_defs.h</p>
<p>config.status: creating nemesis/src/mpid_nem_net_array.c</p>
<p>config.status: creating include/mpidi_ch3i_nemesis_conf.h</p>
<p>config.status: include/mpidi_ch3i_nemesis_conf.h is unchanged</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/mpid/common/locks</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>RUNNING CONFIGURE FOR LOCKS</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... yes</p>
<p>checking for ar... ar</p>
<p>checking for ranlib... ranlib</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for yield... no</p>
<p>checking for sched_yield... yes</p>
<p>checking for usleep... yes</p>
<p>checking for sleep... yes</p>
<p>checking for select... yes</p>
<p>checking for mutex_init... no</p>
<p>checking for compare_and_swap... no</p>
<p>checking for pthread_mutexattr_init... yes</p>
<p>checking for pthread_mutexattr_setpshared... yes</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking pthread.h usability... yes</p>
<p>checking pthread.h presence... yes</p>
<p>checking for pthread.h... yes</p>
<p>checking sched.h usability... yes</p>
<p>checking sched.h presence... yes</p>
<p>checking for sched.h... yes</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking for working volatile... yes</p>
<p>checking for an ANSI C-conforming const... yes</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating mpid_locksconf.h</p>
<p>config.status: mpid_locksconf.h is unchanged</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/mpid/common/locks</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>RUNNING CONFIGURE FOR LOCKS</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... yes</p>
<p>checking for ar... ar</p>
<p>checking for ranlib... ranlib</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for yield... no</p>
<p>checking for sched_yield... yes</p>
<p>checking for usleep... yes</p>
<p>checking for sleep... yes</p>
<p>checking for select... yes</p>
<p>checking for mutex_init... no</p>
<p>checking for compare_and_swap... no</p>
<p>checking for pthread_mutexattr_init... yes</p>
<p>checking for pthread_mutexattr_setpshared... yes</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking pthread.h usability... yes</p>
<p>checking pthread.h presence... yes</p>
<p>checking for pthread.h... yes</p>
<p>checking sched.h usability... yes</p>
<p>checking sched.h presence... yes</p>
<p>checking for sched.h... yes</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking for working volatile... yes</p>
<p>checking for an ANSI C-conforming const... yes</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating mpid_locksconf.h</p>
<p>config.status: mpid_locksconf.h is unchanged</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/mpi/romio</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>Configuring with args --prefix=/home/bob/mpich2-1.2.1-install --exec-prefix=/usr/local/lib/pkgconfig --enable-fast=all, 03 build_alias=03 host_alias=03 target_alias=03 --disable-checkerrors --with-atomic-primitives=auto_allow_emulation</p>

<p>checking for architecture... i686</p>
<p>configure: WARNING: Unknown architecture ... proceeding anyway</p>
<p>ROMIO home directory is /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for 03-g77... g77</p>
<p>checking whether we are using the GNU Fortran 77 compiler... yes</p>
<p>checking whether g77 accepts -g... yes</p>
<p>checking for memalign... yes</p>
<p>checking Fortran external names</p>
<p>Fortran externals are lower case and have two trailing underscores</p>
<p>checking for inline... inline</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking fcntl.h usability... yes</p>
<p>checking fcntl.h presence... yes</p>
<p>checking for fcntl.h... yes</p>
<p>checking malloc.h usability... yes</p>
<p>checking malloc.h presence... yes</p>
<p>checking for malloc.h... yes</p>
<p>checking stddef.h usability... yes</p>
<p>checking stddef.h presence... yes</p>
<p>checking for stddef.h... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking for u_char... yes</p>
<p>checking for u_short... yes</p>
<p>checking for u_int... yes</p>
<p>checking for u_long... yes</p>
<p>checking sys/attr.h usability... no</p>
<p>checking sys/attr.h presence... no</p>
<p>checking for sys/attr.h... no</p>
<p>checking size of int... 4</p>
<p>checking size of void *... 4</p>
<p>checking for int large enough for pointers... yes</p>
<p>checking size of long long... 8</p>
<p>checking for extension for Fortran 90 programs... f90</p>
<p>checking for Fortran 90 KIND parameter for 8-byte integers...            8</p>
<p>checking that we can use integer*8 to declare MPI_DISPLACMENT_CURRENT... yes</p>
<p>Overriding Array test for MPICH2</p>
<p>checking for weak symbol support... pragma weak</p>
<p>checking that weak symbols are visible to other files... no</p>
<p>no</p>
<p>checking whether struct flock compatible with MPI_Offset... yes</p>
<p>checking for pvfs2-config... notfound</p>
<p>checking configured file systems... testfs ufs nfs</p>
<p>configure: WARNING: File locks may not work with NFS.  See the Installation and</p>
<p>users manual for instructions on testing and if necessary fixing this</p>
<p>checking for library containing aio_write... no</p>
<p>checking for library containing pthread_create... none required</p>
<p>checking for library containing aio_write... (cached) no</p>
<p>checking whether aio routines can be used... no</p>
<p>checking for obsolete two-argument aio_write... no</p>
<p>checking for obsolete two-argument aio_suspend... no</p>
<p>checking for aio_fildes member of aiocb structure... no</p>
<p>checking for aio_whence member of aiocb structure... no</p>
<p>checking for aio_handle member of aiocb structure... no</p>
<p>checking for aio_reqprio member of aiocb structure... no</p>
<p>checking for aio_sigevent member of aiocb structure... no</p>
<p>checking sys/vfs.h usability... yes</p>
<p>checking sys/vfs.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/vfs.h... yes</p>
<p>checking sys/param.h usability... yes</p>
<p>checking sys/param.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/param.h... yes</p>
<p>checking sys/mount.h usability... yes</p>
<p>checking sys/mount.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/mount.h... yes</p>
<p>checking sys/statvfs.h usability... yes</p>
<p>checking sys/statvfs.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/statvfs.h... yes</p>
<p>checking whether struct statfs properly defined... yes</p>
<p>checking for f_fstypename member of statfs structure... no</p>
<p>checking for sys/stat.h... (cached) yes</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking for stat... yes</p>
<p>checking for st_fstype member of stat structure... no</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking for sys/statvfs.h... (cached) yes</p>
<p>checking for sys/vfs.h... (cached) yes</p>
<p>checking for statvfs... yes</p>
<p>checking for f_basetype member of statvfs structure... no</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking for large file defines... no</p>
<p>checking for strerror... yes</p>
<p>checking for doctext... false</p>
<p>checking for strdup... yes</p>
<p>checking whether strdup needs a declaration... no</p>
<p>checking for snprintf... yes</p>
<p>checking whether snprintf needs a declaration... no</p>
<p>checking for lstat... yes</p>
<p>checking whether lstat needs a declaration... yes</p>
<p>checking for readlink... yes</p>
<p>checking whether readlink needs a declaration... no</p>
<p>checking for fsync... yes</p>
<p>checking whether fsync needs a declaration... no</p>
<p>checking for ftruncate... yes</p>
<p>checking whether ftruncate needs a declaration... no</p>
<p>checking for lseek64... no</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking for large file defines... none</p>
<p>setting SYSDEP_INC to</p>
<p>checking for C/C++ restrict keyword... __restrict</p>
<p>checking whether __attribute__ allowed... yes</p>
<p>checking whether __attribute__((format)) allowed... yes</p>
<p>setting CC to gcc</p>
<p>setting F77 to g77</p>
<p>setting TEST_CC to /home/bob/mpich2-1.2.1p1/bin/mpicc</p>
<p>setting TEST_F77 to /home/bob/mpich2-1.2.1p1/bin/mpif77</p>
<p>setting CFLAGS to  -DNDEBUG -O2  -DFORTRANDOUBLEUNDERSCORE -DHAVE_ROMIOCONF_H</p>
<p>setting USER_CFLAGS to</p>
<p>setting USER_FFLAGS to</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating localdefs</p>
<p>config.status: creating mpi-io/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi2-other/info/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi2-other/array/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/common/Makefile</p>
<p>config.status: creating test/Makefile</p>
<p>config.status: creating test/misc.c</p>
<p>config.status: creating test/large_file.c</p>
<p>config.status: creating test/runtests</p>
<p>config.status: creating test-internal/Makefile</p>
<p>config.status: creating util/romioinstall</p>
<p>config.status: creating include/mpio.h</p>
<p>config.status: creating include/mpiof.h</p>
<p>config.status: creating adio/ad_nfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_ufs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_bgl/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_bglockless/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_panfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_xfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_sfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_pfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_testfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_pvfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_pvfs2/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_gridftp/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_lustre/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/ad_zoidfs/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi-io/fortran/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi2-other/info/fortran/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi2-other/array/fortran/Makefile</p>
<p>config.status: creating test/fmisc.f</p>
<p>config.status: creating test/fcoll_test.f</p>
<p>config.status: creating test/pfcoll_test.f</p>
<p>config.status: creating test/fperf.f</p>
<p>config.status: creating mpi-io/glue/mpich2/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi-io/glue/mpich1/Makefile</p>
<p>config.status: creating mpi-io/glue/default/Makefile</p>
<p>config.status: creating common/dataloop/Makefile</p>
<p>config.status: creating adio/include/romioconf.h</p>
<p>config.status: executing default-1 commands</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/pmi/simple</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>RUNNING CONFIGURE FOR THE SIMPLE PMI</p>
<p>checking for make... make</p>
<p>checking whether clock skew breaks make... no</p>
<p>checking whether make supports include... yes</p>
<p>checking whether make allows comments in actions... yes</p>
<p>checking for virtual path format... VPATH</p>
<p>checking whether make sets CFLAGS... yes</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking for string.h... (cached) yes</p>
<p>checking for stdlib.h... (cached) yes</p>
<p>checking sys/socket.h usability... yes</p>
<p>checking sys/socket.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/socket.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... (cached) yes</p>
<p>checking assert.h usability... yes</p>
<p>checking assert.h presence... yes</p>
<p>checking for assert.h... yes</p>
<p>checking for snprintf... yes</p>
<p>checking whether snprintf needs a declaration... no</p>
<p>checking for strncasecmp... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... (cached) yes</p>
<p>checking sys/param.h usability... yes</p>
<p>checking sys/param.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/param.h... yes</p>
<p>checking for sys/socket.h... (cached) yes</p>
<p>checking netinet/in.h usability... yes</p>
<p>checking netinet/in.h presence... yes</p>
<p>checking for netinet/in.h... yes</p>
<p>checking netinet/tcp.h usability... yes</p>
<p>checking netinet/tcp.h presence... yes</p>
<p>checking for netinet/tcp.h... yes</p>
<p>checking sys/un.h usability... yes</p>
<p>checking sys/un.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/un.h... yes</p>
<p>checking netdb.h usability... yes</p>
<p>checking netdb.h presence... yes</p>
<p>checking for netdb.h... yes</p>
<p>checking for library containing socket... none required</p>
<p>checking for library containing gethostbyname... none required</p>
<p>checking for socket... yes</p>
<p>checking for setsockopt... yes</p>
<p>checking for gethostbyname... yes</p>
<p>checking whether socklen_t is defined (in sys/socket.h if present)... yes</p>
<p>checking whether struct hostent contains h_addr_list... yes</p>
<p>checking whether __attribute__ allowed... yes</p>
<p>checking whether __attribute__((format)) allowed... yes</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating localdefs</p>
<p>config.status: creating pmiconf.h</p>
<p>config.status: pmiconf.h is unchanged</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/pm/mpd</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>Configuring with args --prefix=/home/bob/mpich2-1.2.1-install --exec-prefix=/usr/local/lib/pkgconfig --enable-fast=all, 03 build_alias=03 host_alias=03 target_alias=03 --disable-checkerrors --with-atomic-primitives=auto_allow_emulation</p>

<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking whether make sets $(MAKE)... yes</p>
<p>checking whether ln -s works... yes</p>
<p>checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c</p>
<p>checking whether install /usr/bin/install -c works... yes</p>
<p>Using INSTALL=/usr/bin/install -c</p>
<p>checking for totalview... no</p>
<p>checking for python2.6... no</p>
<p>checking for python2.5... no</p>
<p>checking for python2.4... no</p>
<p>checking for python2.3... no</p>
<p>checking for python2.2... no</p>
<p>checking for python2... no</p>
<p>checking for python... python</p>
<p>checking that python is a valid python version... yes</p>
<p>checking that the cPickle module is available for python... yes</p>
<p>checking that rebaseall is ok on this cygwin system...</p>
<p>checking for library containing socket... none required</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking fcntl.h usability... yes</p>
<p>checking fcntl.h presence... yes</p>
<p>checking for fcntl.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... (cached) yes</p>
<p>checking sys/time.h usability... yes</p>
<p>checking sys/time.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/time.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... (cached) yes</p>
<p>checking for stdlib.h... (cached) yes</p>
<p>checking sys/param.h usability... yes</p>
<p>checking sys/param.h presence... yes</p>
<p>checking for sys/param.h... yes</p>
<p>checking for putenv... yes</p>
<p>checking for socket... yes</p>
<p>checking for snprintf... yes</p>
<p>checking whether snprintf needs a declaration... no</p>
<p>configure: creating ./config.status</p>
<p>config.status: creating Makefile</p>
<p>config.status: creating mpdconf.h</p>
<p>configure: WARNING: unrecognized options: --enable-fast, --disable-checkerrors, --with-atomic-primitives</p>
<p>configure: configuring subsystem in src/pm/hydra</p>
<p>configure: WARNING: you should use --build, --host, --target</p>
<p>checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c</p>
<p>checking whether build environment is sane... yes</p>
<p>checking for a thread-safe mkdir -p... mkdir -p</p>
<p>checking for gawk... gawk</p>
<p>checking whether make sets $(MAKE)... yes</p>
<p>checking for 03-gcc... gcc</p>
<p>checking for C compiler default output file name... a.exe</p>
<p>checking whether the C compiler works... yes</p>
<p>checking whether we are cross compiling... no</p>
<p>checking for suffix of executables... .exe</p>
<p>checking for suffix of object files... o</p>
<p>checking whether we are using the GNU C compiler... yes</p>
<p>checking whether gcc accepts -g... yes</p>
<p>checking for gcc option to accept ISO C89... none needed</p>
<p>checking for style of include used by make... GNU</p>
<p>checking dependency style of gcc... gcc3</p>
<p>checking how to run the C preprocessor... gcc -E</p>
<p>checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep</p>
<p>checking for egrep... /usr/bin/grep -E</p>
<p>checking for ANSI C header files... yes</p>
<p>checking for sys/types.h... yes</p>
<p>checking for sys/stat.h... yes</p>
<p>checking for stdlib.h... yes</p>
<p>checking for string.h... yes</p>
<p>checking for memory.h... yes</p>
<p>checking for strings.h... yes</p>
<p>checking for inttypes.h... yes</p>
<p>checking for stdint.h... yes</p>
<p>checking for unistd.h... yes</p>
<p>checking for size_t... yes</p>
<p>checking build system type... Invalid configuration `03': machine `03' not recognized</p>
<p>configure: error: /bin/sh mpl/confdb/config.sub 03 failed</p>
<p>configure: error: Configure of src/pm/hydra failed!</p><p> </p><p>then I run make:</p><font size="1"><p>Beginning make</p><p>
</p><p>Using variables CC='gcc' CFLAGS=' -DNDEBUG -O2' LDFLAGS=' -lrt' AR='ar' FC='g77' F90='gfortran' FFLAGS=' -DNDEBUG -O2' F90FLAGS=' -DNDEBUG' CXX='c++' CPPFLAGS=' -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src -DUSE_PROCESS_LOCKS  -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/include -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/monitor -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/monitor -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/wrappers -I/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/wrappers'</p>
<p>
</p><p>make all-local</p><p>
</p><p>make[1]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1'</p><p>
</p><p>make[1]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1'</p><p>
</p><p>make[1]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa'</p><p>
</p><p>Making all in src</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src'</p><p>
</p><p>make  all-am</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/src'</p><p>
</p><p>Making all in test</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/test'</p><p>
</p><p>make[2]: Nothing to be done for `all'.</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa/test'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa'</p><p>
</p><p>make[2]: Nothing to be done for `all-am'.</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa'</p><p>
</p><p>make[1]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/openpa'</p><p>
</p><p>make[1]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/locks'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype'</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype/dataloop'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype/dataloop'</p><p>
</p><p>make all-local</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common/datatype'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/common'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels'</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis'</p><p>
</p><p>make[6]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis'</p><p>
</p><p>make[7]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/src'</p><p>
</p><p>  CC              mpid_nem_net_array.c</p><p>
</p><p>  AR cr ../../../../../../../lib/libmpich.a mpid_nem_net_array.o</p><p>
</p><p>  RANLIB          libmpich.a</p><p>
</p><p>date > .libstamp0</p><p>
</p><p>make[7]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/src'</p><p>
</p><p>make[7]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/netmod'</p><p>
</p><p>make[8]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/netmod/tcp'</p><p>
</p><p>make[8]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/netmod/tcp'</p><p>
</p><p>make[7]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/netmod'</p><p>
</p><p>make[7]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils'</p><p>
</p><p>make[8]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/monitor'</p><p>
</p><p>make[8]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/monitor'</p><p>
</p><p>make[8]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/replacements'</p><p>
</p><p>make[8]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils/replacements'</p><p>
</p><p>make[7]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis/utils'</p><p>
</p><p>make[6]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/nemesis'</p><p>
</p><p>make[6]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/src'</p><p>
</p><p>make[6]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis/src'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels/nemesis'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/channels'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/src'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/src'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/util'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3/util'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid/ch3'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpid'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/attr'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/attr'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/attr'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/attr'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/coll'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/coll'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/coll'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/coll'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/comm'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/comm'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/comm'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/comm'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/datatype'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/datatype'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/datatype'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/datatype'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/errhan'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/errhan'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/errhan'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/errhan'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/group'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/group'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/group'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/group'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/init'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/init'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/init'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/init'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/misc'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/misc'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/misc'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/misc'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/pt2pt'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/pt2pt'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/pt2pt'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/pt2pt'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/rma'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/rma'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/rma'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/rma'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/spawn'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/spawn'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/spawn'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/spawn'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/timer'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/timer'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/timer'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/timer'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/topo'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/topo'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/topo'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/topo'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>
</p><p>make mpiolib</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory mpi-io</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory adio/common</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/common'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/common'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory mpi-io/glue/mpich2</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io/glue/mpich2'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io/glue/mpich2'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory adio/ad_testfs</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_testfs'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_testfs'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory adio/ad_ufs</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_ufs'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_ufs'</p><p>

</p><p>compiling ROMIO in directory adio/ad_nfs</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_nfs'</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/adio/ad_nfs'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>

</p><p>building profiling interface in directory mpi-io</p><p>
</p><p>make[5]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io'</p><p>
</p><p>ar cr /home/bob/mpich2-1.2.1p1/lib/libmpich.a _close.o _read.o _open.o _get_extent.o  _write.o _set_view.o _seek.o _read_at.o _prealloc.o  _iread.o _iwrite.o  _get_posn.o  _delete.o _read_all.o _get_bytoff.o  _read_atall.o _iread_at.o _iwrite_at.o _get_group.o _get_amode.o  _write_all.o _write_at.o _write_atall.o _get_view.o  _fsync.o _get_atom.o _set_atom.o _set_size.o _get_size.o  _file_f2c.o _file_c2f.o  _set_info.o _get_info.o  _rd_atallb.o _rd_atalle.o _read_allb.o _read_alle.o _wr_atallb.o  _wr_atalle.o _write_allb.o _write_alle.o  _get_posn_sh.o _iread_sh.o _read_sh.o _write_sh.o  _iwrite_sh.o _seek_sh.o _read_ord.o _read_orde.o _write_ordb.o  _read_ordb.o _write_ord.o _write_orde.o _register_datarep.o</p>
<p>
</p><p>ranlib /home/bob/mpich2-1.2.1p1/lib/libmpich.a</p><p>
</p><p>make[5]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio/mpi-io'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi/romio'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpi'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/mem'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/mem'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/info'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/info'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp2' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/info'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/info'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/msgs'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/msgs'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/instrm'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/instrm'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/thread'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/thread'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/dbg'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/dbg'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/param'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/param'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/osserv'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/osserv'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/procmap'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/procmap'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/other'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util/other'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/util'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/nameserv'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/nameserv/mpd'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/nameserv/mpd'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/nameserv'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/f77'</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/f77'</p><p>
</p><p>make[4]: `.libstamp4' is up to date.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/f77'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/f77'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/cxx'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding/cxx'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/binding'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/env'</p><p>
</p><p>make[2]: Nothing to be done for `all'.</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/env'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging/pkgconfig'</p><p>
</p><p>make[3]: Nothing to be done for `all'.</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging/pkgconfig'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging/envmods'</p><p>
</p><p>make[3]: Nothing to be done for `all'.</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging/envmods'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/packaging'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2'</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>

</p><p>**** Making src/misc ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  mpe_debug_objs</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a</p><p>
</p><p>/home/bob/mpich2-1.2.1p1/bin/mpicc -I.. -I../include  -I../../.. -I../../../include   -o dbxerr.po -c dbxerr.c</p><p>
</p><p>dbxerr.c: In function ‘MPE_DefaultHandler’:</p><p>
</p><p>dbxerr.c:429:1: error: expected ‘=’, ‘,’, ‘;’, ‘asm’ or ‘__attribute__’ before ‘{’ token</p><p>
</p><p>dbxerr.c:459:1: error: expected ‘=’, ‘,’, ‘;’, ‘asm’ or ‘__attribute__’ before ‘{’ token</p><p>
</p><p>dbxerr.c:408:6: error: argument ‘sig’ doesn’t match prototype</p><p>
</p><p>dbxerr.c:407:6: error: prototype declaration</p><p>
</p><p>dbxerr.c:475:1: error: expected ‘{’ at end of input</p><p>
</p><p>Makefile:82: recipe for target `dbxerr.po' failed</p><p>
</p><p>make[7]: *** [dbxerr.po] Error 1</p><p>
</p><p>Makefile:111: recipe for target `default' failed</p><p>
</p><p>make[6]: *** [default] Error 2</p><p>
</p><p>Makefile:43: recipe for target `build_lib_bin' failed</p><p>
</p><p>make[5]: *** [build_lib_bin] Error 2</p><p>
</p><p>Makefile:26: recipe for target `all' failed</p><p>
</p><p>make[4]: *** [all] Error 2</p><p>

</p><p>**** Making src/callstack ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/check_callstack.exe</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/check_callstack.exe' is up to date.</p><p>

</p><p>**** Making src/logging ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi_null.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi_null.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_null.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_null.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_print.exe  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_join.exe  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_repair.exe</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_print.exe' is up to date.</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_join.exe' is up to date.</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/bin/clog2_repair.exe' is up to date.</p><p>

</p><p>**** Making src/wrappers ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/liblmpe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/liblmpe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libtmpe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libtmpe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_f2cmpi.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/mpe_prof.o</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/mpe_prof.o' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_all</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_C</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_F77</p><p>

</p><p>　</p><p>
</p><p>**** Making src/graphics ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_nompi.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libampe.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libampe.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_all</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_C</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_F77</p><p>

</p><p>　</p><p>
</p><p>**** Making src/collchk ....</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  build_lib_bin</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_collchk.a</p><p>
</p><p>make[7]: `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2/lib/libmpe_collchk.a' is up to date.</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_all</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_C</p><p>
</p><p>make --no-print-directory  linktest_F77</p><p>

</p><p>　</p><p>
</p><p>**** Making src/slog2sdk ....</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpe2'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pmi'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pmi/simple'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pmi/simple'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pmi'</p><p>
</p><p>make[2]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd'</p><p>
</p><p>gcc -I. -I. -DNDEBUG -O2  -c  mpdroot.c</p><p>
</p><p>gcc -DNDEBUG -O2  -lrt -o mpdroot mpdroot.o -lpthread</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/hydra'</p><p>
</p><p>Making all in ../../mpl</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpl'</p><p>
</p><p>make[4]: Nothing to be done for `all'.</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/mpl'</p><p>
</p><p>Making all in .</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/hydra'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/hydra'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/hydra'</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/gforker'</p><p>
</p><p>cd ../util && make</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/util'</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/util'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/gforker'</p><p>
</p><p>make all-postamble</p><p>
</p><p>make[3]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm'</p><p>
</p><p>if [ -n "mpd" -a -d "mpd" ] ; then \</p><p>
</p><p>build_prefix=`cd ../.. && pwd` && cd mpd && \</p><p>
</p><p>make prefix=$build_prefix exec_prefix=$build_prefix bindir=$build_prefix/bin mpich2-build-install ; \</p><p>
</p><p>fi</p><p>
</p><p>make[4]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd'</p><p>
</p><p>/usr/bin/install -c -m 644 ./mpdroot.c mpich2-mpdroot.c</p><p>
</p><p>gcc -I. -I. -DNDEBUG -O2  -c mpich2-mpdroot.c</p><p>
</p><p>rm -f mpich2-mpdroot.c</p><p>
</p><p>gcc -DNDEBUG -O2  -lrt -o mpich2-mpdroot mpich2-mpdroot.o -lpthread</p><p>
</p><p>rm -f mpich2-mpdroot.o</p><p>
</p><p>copying python files/links into  /home/bob/mpich2-1.2.1p1/bin</p><p>
</p><p>rm -f mpich2-mpdroot</p><p>
</p><p>make[4]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm/mpd'</p><p>
</p><p>make[3]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm'</p><p>
</p><p>make[2]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src/pm'</p><p>
</p><p>make[1]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/src'</p><p>
</p><p>make[1]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/examples'</p><p>
</p><p>../bin/mpicc   -o cpi cpi.o  -lm</p><p>
</p><p>make[1]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1/examples'</p><p>
</p><p>make all-postamble</p><p>
</p><p>make[1]: Entering directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1'</p><p>
</p><p>Make completed</p><p>
</p><p>make[1]: Leaving directory `/home/bob/mpich2-1.2.1p1</p><p> </p><p>then I do make install and I got some problem:</p><p> </p><p> </p><font size="1"><p>if [ ! -d /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install ] ; then mkdir -p /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install ; fi</p>

<p>if [ ! -d /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share ] ; then mkdir -p /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share ; fi</p>
<p>if [ ! -d /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share/doc/ ] ; then mkdir -p /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share/doc/ ; fi</p>
<p>if [ ! -d /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share/man ] ; then mkdir -p /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/share/man ; fi</p>
<p>if [ ! -d /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/include ] ; then mkdir -p /usr/home/bob/mpich2-1.2.1-install/include ; fi</p>
<p><strong><font>if [ ! -d //usr/local/lib/pkgconfig ] ; then mkdir -p //usr/local/lib/pkgconfig ; fi</font></strong></p><strong><font>
</font></strong><p><strong><font>mkdir: cannot create directory `//usr': Read-only file system</font></strong></p>
<p>Makefile:194: recipe for target `install' failed</p>
<p>make: *** [install] Error 1</p></font></font><p> </p></font></font></div><div><font size="1"></font><br>any help will be very appreciated!!! </div><div> </div><div>I wish to hear from you</div><div> </div><div>Angelo</div>
<div dir="ltr"><div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif"></font> </div>
<div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif"></font> </div><div><font face="georgia,serif">Angelo Paone</font></div><div><font face="georgia,serif">***********************************************</font></div>
<div><font face="georgia,serif">Research Professor</font></div><div><font face="georgia,serif">Post-Doctoral Research Fellow</font></div><div><font face="Georgia">Marie Curie Fellow</font></div><div><font face="georgia,serif">PhD, MSc, BSc</font></div>
<div><font face="georgia,serif">Pusan Natioanl University</font></div><div><font face="georgia,serif">Department of Earth Science</font></div><div><font face="Georgia">30, Jangjeon-dong, Geumjeong-gu</font></div><div><font face="georgia,serif">Busan, Republic of Korea</font></div>
<div><font face="Georgia">Tel. +82-51-510-2987</font></div></div>
</div>