[mpich-discuss] Running mpi from bash script

[Francisco Pastor]

Hi everyone

I need to daily run an mpi job from a bash script. I have prepared the 
script and run from the command line, this works fine. But when I try to 
execute at a later time with at (at -f my_script now +1 minute) the 
parallel processes do not start.

These are the significant parts of my script:

# path to mpi executables
ruta_mpi=/usr/local/mpich2-1.0.5p4/bin

# Function that checks if mpd processes are ok (checks mpdtrace output, 
five nodes should be up)
Comprueba_MPD()
{
   mpdtrace > log.mpd
   wc -l log.mpd > check.mpd
   check1=`awk '{ print $1 }' check.mpd`
   if [ $check1 -eq 5 ];
     then
        echo "Salida de mpdtrace correcta, hosts=$check1"
     else
        echo "Salida de mpdtrace incorrecta, hosts=$check1"
        $ruta_mpi/mpdboot -n 5 &
        sleep 10
        mpdtrace
   fi
}


# Run rams60 program with mpirun
time $ruta_mpi/mpirun -n 21 ./rams60 -f RAMSIN.operatiu

I am sure missing something but I can't find out what's going on.

Thanks in advance

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Dr. Francisco Pastor
Meteorology department, Instituto Universitario CEAM-UMH
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