[mpich-discuss] MPICH symmetric mode execution on Xeon Phi
mahdiyeh ghazi
mahdiyeh.ghazi67 at gmail.com
Mon Oct 19 11:56:21 CDT 2015
Thank you Dmitry,
Here is the output in verbose mode:
host: aster01-mic0
host: aster01
==================================================================================================
mpiexec options:
----------------
Base path: /opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin/./
Launcher: (null)
Debug level: 1
Enable X: -1
Global environment:
-------------------
MANPATH=/opt/intel/impi/
4.1.0.024/man:/usr/local/share/man:/usr/share/man
XDG_SESSION_ID=75
HOSTNAME=aster01
TERM=xterm
SHELL=/bin/bash
HISTSIZE=1000
SSH_CLIENT=192.168.2.1 47980 22
OLDPWD=/opt/new-mpich/mpich-3.1.4/1/bin
SSH_TTY=/dev/pts/0
USER=root
LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/compiler/lib/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/lib:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/home/farajii/installation-files/fedora20/gdrcopy-master
LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=01;05;37;41:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=01;36:*.au=01;36:*.flac=01;36:*.mid=01;36:*.midi=01;36:*.mka=01;36:*.mp3=01;36:*.mpc=01;36:*.ogg=01;36:*.ra=01;36:*.wav=01;36:*.axa=01;36:*.oga=01;36:*.spx=01;36:*.xspf=01;36:
MAIL=/var/spool/mail/root
PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin::/home/ghazim/build/aster/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/
PWD=/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin
LANG=en_US.UTF-8
HISTCONTROL=ignoredups
SHLVL=1
HOME=/root
LOGNAME=root
CVS_RSH=ssh
SSH_CONNECTION=192.168.2.1 47980 192.168.2.121 22
LESSOPEN=||/usr/bin/lesspipe.sh %s
XDG_RUNTIME_DIR=/run/user/0
I_MPI_ROOT=/opt/intel/impi/4.1.0.024
_=./mpiexec.hydra
Hydra internal environment:
---------------------------
GFORTRAN_UNBUFFERED_PRECONNECTED=y
Proxy information:
*********************
[1] proxy: aster01-mic0 (1 cores)
Exec list: ./hellomic (1 processes);
[2] proxy: aster01 (1 cores)
Exec list: ./hello-host (1 processes);
==================================================================================================
[mpiexec at aster01] Timeout set to -1 (-1 means infinite)
[mpiexec at aster01] Got a control port string of aster01:51327
Proxy launch args: /opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin/./hydra_pmi_proxy
--control-port aster01:51327 --debug --rmk user --launcher ssh --demux poll
--pgid 0 --retries 10 --usize -2 --proxy-id
Arguments being passed to proxy 0:
--version 3.1.4 --iface-ip-env-name MPIR_CVAR_CH3_INTERFACE_HOSTNAME
--hostname aster01-mic0 --global-core-map 0,1,2 --pmi-id-map 0,0
--global-process-count 2 --auto-cleanup 1 --pmi-kvsname kvs_5294_0
--pmi-process-mapping (vector,(0,2,1)) --ckpoint-num -1
--global-inherited-env 26 'MANPATH=/opt/intel/impi/
4.1.0.024/man:/usr/local/share/man:/usr/share/man' 'XDG_SESSION_ID=75'
'HOSTNAME=aster01' 'TERM=xterm' 'SHELL=/bin/bash' 'HISTSIZE=1000'
'SSH_CLIENT=192.168.2.1 47980 22' 'OLDPWD=/opt/new-mpich/mpich-3.1.4/1/bin'
'SSH_TTY=/dev/pts/0' 'USER=root'
'LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/compiler/lib/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/lib:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/home/farajii/installation-files/fedora20/gdrcopy-master'
'LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=01;05;37;41:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=01;36:*.au=01;36:*.flac=01;36:*.mid=01;36:*.midi=01;36:*.mka=01;36:*.mp3=01;36:*.mpc=01;36:*.ogg=01;36:*.ra=01;36:*.wav=01;36:*.axa=01;36:*.oga=01;36:*.spx=01;36:*.xspf=01;36:'
'MAIL=/var/spool/mail/root'
'PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin::/home/ghazim/build/aster/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/'
'PWD=/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin' 'LANG=en_US.UTF-8'
'HISTCONTROL=ignoredups' 'SHLVL=1' 'HOME=/root' 'LOGNAME=root'
'CVS_RSH=ssh' 'SSH_CONNECTION=192.168.2.1 47980 192.168.2.121 22'
'LESSOPEN=||/usr/bin/lesspipe.sh %s' 'XDG_RUNTIME_DIR=/run/user/0'
'I_MPI_ROOT=/opt/intel/impi/4.1.0.024' '_=./mpiexec.hydra'
--global-user-env 0 --global-system-env 1
'GFORTRAN_UNBUFFERED_PRECONNECTED=y' --proxy-core-count 1 --exec
--exec-appnum 0 --exec-proc-count 1 --exec-local-env 0 --exec-wdir
/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin --exec-args 1 ./hellomic
Arguments being passed to proxy 1:
--version 3.1.4 --iface-ip-env-name MPIR_CVAR_CH3_INTERFACE_HOSTNAME
--hostname aster01 --global-core-map 0,1,2 --pmi-id-map 0,1
--global-process-count 2 --auto-cleanup 1 --pmi-kvsname kvs_5294_0
--pmi-process-mapping (vector,(0,2,1)) --ckpoint-num -1
--global-inherited-env 26 'MANPATH=/opt/intel/impi/
4.1.0.024/man:/usr/local/share/man:/usr/share/man' 'XDG_SESSION_ID=75'
'HOSTNAME=aster01' 'TERM=xterm' 'SHELL=/bin/bash' 'HISTSIZE=1000'
'SSH_CLIENT=192.168.2.1 47980 22' 'OLDPWD=/opt/new-mpich/mpich-3.1.4/1/bin'
'SSH_TTY=/dev/pts/0' 'USER=root'
'LD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/compiler/lib/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/lib:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/usr/local/cuda-6.5/lib64/:/home/farajii/installation-files/fedora20/gdrcopy-master'
'LS_COLORS=rs=0:di=01;34:ln=01;36:mh=00:pi=40;33:so=01;35:do=01;35:bd=40;33;01:cd=40;33;01:or=40;31;01:mi=01;05;37;41:su=37;41:sg=30;43:ca=30;41:tw=30;42:ow=34;42:st=37;44:ex=01;32:*.tar=01;31:*.tgz=01;31:*.arc=01;31:*.arj=01;31:*.taz=01;31:*.lha=01;31:*.lzh=01;31:*.lzma=01;31:*.tlz=01;31:*.txz=01;31:*.tzo=01;31:*.t7z=01;31:*.zip=01;31:*.z=01;31:*.Z=01;31:*.dz=01;31:*.gz=01;31:*.lrz=01;31:*.lz=01;31:*.lzo=01;31:*.xz=01;31:*.bz2=01;31:*.bz=01;31:*.tbz=01;31:*.tbz2=01;31:*.tz=01;31:*.deb=01;31:*.rpm=01;31:*.jar=01;31:*.war=01;31:*.ear=01;31:*.sar=01;31:*.rar=01;31:*.alz=01;31:*.ace=01;31:*.zoo=01;31:*.cpio=01;31:*.7z=01;31:*.rz=01;31:*.cab=01;31:*.jpg=01;35:*.jpeg=01;35:*.gif=01;35:*.bmp=01;35:*.pbm=01;35:*.pgm=01;35:*.ppm=01;35:*.tga=01;35:*.xbm=01;35:*.xpm=01;35:*.tif=01;35:*.tiff=01;35:*.png=01;35:*.svg=01;35:*.svgz=01;35:*.mng=01;35:*.pcx=01;35:*.mov=01;35:*.mpg=01;35:*.mpeg=01;35:*.m2v=01;35:*.mkv=01;35:*.ogm=01;35:*.mp4=01;35:*.m4v=01;35:*.mp4v=01;35:*.vob=01;35:*.qt=01;35:*.nuv=01;35:*.wmv=01;35:*.asf=01;35:*.rm=01;35:*.rmvb=01;35:*.flc=01;35:*.avi=01;35:*.fli=01;35:*.flv=01;35:*.gl=01;35:*.dl=01;35:*.xcf=01;35:*.xwd=01;35:*.yuv=01;35:*.cgm=01;35:*.emf=01;35:*.axv=01;35:*.anx=01;35:*.ogv=01;35:*.ogx=01;35:*.aac=01;36:*.au=01;36:*.flac=01;36:*.mid=01;36:*.midi=01;36:*.mka=01;36:*.mp3=01;36:*.mpc=01;36:*.ogg=01;36:*.ra=01;36:*.wav=01;36:*.axa=01;36:*.oga=01;36:*.spx=01;36:*.xspf=01;36:'
'MAIL=/var/spool/mail/root'
'PATH=/opt/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/opt/intel/impi/
4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/opt/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin::/home/ghazim/build/aster/intel/composer_xe_2015.3.187/bin/intel64:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/cuda-6.5/bin:/home/farajii/builds/11-mv2.2.1/bin/'
'PWD=/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin' 'LANG=en_US.UTF-8'
'HISTCONTROL=ignoredups' 'SHLVL=1' 'HOME=/root' 'LOGNAME=root'
'CVS_RSH=ssh' 'SSH_CONNECTION=192.168.2.1 47980 192.168.2.121 22'
'LESSOPEN=||/usr/bin/lesspipe.sh %s' 'XDG_RUNTIME_DIR=/run/user/0'
'I_MPI_ROOT=/opt/intel/impi/4.1.0.024' '_=./mpiexec.hydra'
--global-user-env 0 --global-system-env 1
'GFORTRAN_UNBUFFERED_PRECONNECTED=y' --proxy-core-count 1 --exec
--exec-appnum 1 --exec-proc-count 1 --exec-local-env 0 --exec-wdir
/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin --exec-args 1 ./hello-host
[mpiexec at aster01] Launch arguments: /usr/bin/ssh -x aster01-mic0
"/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin/./hydra_pmi_proxy" --control-port
aster01:51327 --debug --rmk user --launcher ssh --demux poll --pgid 0
--retries 10 --usize -2 --proxy-id 0
[mpiexec at aster01] Launch arguments:
/opt/new-mpich-host/mpich-3.1.4/1/bin/./hydra_pmi_proxy --control-port
aster01:51327 --debug --rmk user --launcher ssh --demux poll --pgid 0
--retries 10 --usize -2 --proxy-id 1
equal
[proxy:unset at aster01] HYD_pmcd_pmip_get_params
(pm/pmiserv/pmip_utils.c:701): server name not available
[proxy:unset at aster01] main (pm/pmiserv/pmip.c:169): bad parameters passed
to the proxy
[mpiexec at aster01] HYD_pmcd_pmiserv_proxy_init_cb
(pm/pmiserv/pmiserv_cb.c:445): assert (!closed) failed
[mpiexec at aster01] HYDT_dmxu_poll_wait_for_event
(tools/demux/demux_poll.c:76): callback returned error status
[mpiexec at aster01] HYD_pmci_wait_for_completion
(pm/pmiserv/pmiserv_pmci.c:198): error waiting for event
[mpiexec at aster01] main (ui/mpich/mpiexec.c:344): process manager error
waiting for completion
any suggestion?
Thanks,
Mahdieh
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