[mpich-discuss] mpirun not running in batch mode.

Lu, Huiwei huiweilu at mcs.anl.gov
Wed Jun 11 09:29:29 CDT 2014


Which is the script that runs mpi job? Could you give us the content of that script?
—
Huiwei

On Jun 11, 2014, at 9:27 AM, Francisco Pastor <paco at ceam.es> wrote:

> Output of crontab -l
> 
> # Edit this file to introduce tasks to be run by cron.
> 
> MAILTO="paco at ceam.es"
> 
> # m h  dom mon dow   command
> 
> #------------------------------------------------------------------
> # Procesos relativos a la descarga de GFS
> #------------------------------------------------------------------
> 00 6,18 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/GFS_descarga_diaria.bash
> 30 8,20 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/mail_logs.bash
> 15 6,18 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/GFS_2_RAMS.bash
> 00 2 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/limpia_logs.bash
> 00 2 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/limpia_dp.bash
> 0,15,30,45 * * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/test-sistema-ventus.bash
> 0,15,30,45 * * * * /home/meteo/scripts/control-temperatura.bash
> 50 00,13 * * * /home/meteo/R/thalassa/RAMS-graficar-serie-temperatura-onades.bash
> 
> # Prova d'execució de RAMS a les 7 i les 19
> 
> 00 7,19 * * * /home/meteo/RAMS/SCRIPTS/RAMS_operatiu.bash
> 
> El 11/06/2014 15:49, Lu, Huiwei escribió:
>> Could you give us the output of the following command: "crontab -l" ?
>> 
>>>> Huiwei
>> 
>> On Jun 11, 2014, at 8:02 AM, Francisco Pastor <paco at ceam.es> wrote:
>> 
>>> Hi
>>> 
>>> This file contains some model configuration parameter. It lies in the same directory where model is being executed. Don't think the problem comes from this point. The running command is rams60 (owned by meteo), a symbolic link to rams-6.0-opt (owned by root)
>>> 
>>> lrwxrwxrwx 1 meteo meteo 39 mar 12 11:57 rams60 -> /usr/local/rams60/build/60/rams-6.0-opt
>>> 
>>> -rwxr-xr-x 1 root root 5009008 jun 11 11:34 /usr/local/rams60/build/60/rams-6.0-opt
>>> 
>>> Thanks
>>> 
>>> 
>>> El 11/06/2014 14:03, Lu, Huiwei escribió:
>>>> Is the file RAMSIN.operatiu at the home directory?
>>>> You may want to give cron script the complete path to that file.
>>>> 
>>>>>>>> Huiwei
>>>> 
>>>> On Jun 11, 2014, at 3:55 AM, Francisco Pastor <paco at ceam.es> wrote:
>>>> 
>>>>>    meteo at ventus:~/RAMS/RUN$ ps -ef | grep rams
>>>>>    meteo    20324 18460  0 09:32 ?        00:00:00 python2 /usr/local/mpich2-1.0.5p4/bin/mpirun -envall -n 40 ./rams60 -f RAMSIN.operatiu
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